Hace parte del complejo religioso La Merced, sin embargo hoy su manejo administrativo está a cargo del Fondo de Promoción de la Cultura del Banco Popular quien por los años 70´s invirtió recursos para la restauración del complejo y en contraprestación le fue vendido este espacio donde funcionaba el primer hospital de la ciudad. Años más tarde se inaugura como museo después de recuperar piezas arqueológicas prehispánicas de siete culturas indígenas que habitaron principalmente el suroccidente del país.
Piezas de culturas ubicadas en territorios como Calima, Tumaco, Tierradentro, Tolima, Nariño, San Agustín y Quimbaya, son exhibidas en las distintas salas del recinto. Platos, vasijas, rodillos, ocarinas entre otras figuras componen la colección.
Cuenta con una sala de explosión temporal, un pequeño auditorio con capacidad para 60 personas y un patio interior con amplios zaguanes, columnas y techos de madera originales de la edificación que data de mediados del siglo XVI, reconocida como la construcción arquitectónica más antigua de la ciudad.
El museo también ofrece actividades educativas y culturales relacionadas con la arqueología y la tradición.
Secretaría de Turismo: Avenida 2N # 2N-22
Lunes a viernes de 9 a.m. a 12 m. y de 2 a 5 p.m.
Centro Cultural: Carrera 4 con calle 6 Esquina
Lunes a viernes de 9 a.m. a 12 m. y de 2 a 5 p.m.
Colina de San Antonio: Carrera 10 con calle 1 oeste
Lunes a sábado de 11 a.m. a 1 p.m. y de 2 a 6 p.m.
Terminal de transporte: Calle 30N #2AN-29
Lunes a sábado de 10 a.m. a 12:30 p.m. y de 2 a 5 p.m.